निपाह वायरस एक उभरती हुई ज़ूनोटिक रोगजनक (जानवरों से मनुष्यों को प्रेषित एक वायरस) है। इस वायरस के बारे में 1998 में मलेशिया के कंपंग सुंगई निपा में पहली बार पता चला। उस समय वहां के ज्यादातर सूअर में इसका वायरस मिला था और सूअर निपा वायरस को फ़ैलाने का कारण थे। परन्तु मुख्य रूप से यह वायरस फल खाने वाले चमगादड़ फैलाते हैं। 2004 में, बांग्लादेश के लोगों में भी निपा वायरस पाए गए थे जिनका कारण फल खाने वाले चमगादड़ के द्वारा दूषित या खाया किया हुआ फल जैसे ताड़, खजूर, आम आदि था। डब्ल्यूएचओ ने इस वायरस को अपनी ‘ब्लूप्रिंट प्राथमिकता’ रोग श्रेणी में सूचीबद्ध किया है।